水源热泵系统优点
1. 水体的温度一年四季相对稳定，其波动的范围远小于空气的变动，水体温度较恒定的特性，使得热泵机组运行可靠、稳定，也保证了系统的高效性和经济性。
2. 在水资源丰富的地区，采取水源热泵，施工难度小，换热效果好。
3. 由于是与地下水直接接触，与地下水没有换热温差存在，换热效率高。
4. 直接利用地下水系统；该系统占地面积小，在不破坏水资源的同时，充分利用其内在的巨大能量，甚至可在地下水层处直接进行能量交换。
水源热泵系统缺点
1. 需要充足的地下水资源作为先决条件，部分地区已规定不准开采地下水。
2. 井水回灌难落实，经常出现回灌井堵塞，无法做到100%回灌，造成地下水资源的浪费，可能会引起地面沉降。
3. 地下水没有经过处理就进入机组，对机组和管道有腐蚀作用，且机组系统容易被地下水中的泥砂所堵塞。
4. 地下水还含有不同的离子、分子、化合物和气体，使地下水具有酸碱度、硬度、腐蚀性等化学性质，会对机组材质造成一定的影响。
5. 如果地下水位低，成井费用将增加，运行中水泵降低系统效率。
6. 水源热泵具备执行自动保护的功能，当水流量过低保护、制冷剂低压或高压保护启动时，机组将频繁的自动保护，从而影响正常使用。
7. 水源热泵系统容易发生源侧与负荷侧的水串水现象。
8. 地下水被抽到地面及在管道中流动并回灌到地下的过程中不可避免地要同空气接触，温度升高和压力下降都会使原来溶于水中的气体释放出来必然会带有一定量的气泡，气体一时难以溶解和溢出，易造成含水层堵塞。
9. 当水量分配不均、断水或水量过少时，会在换热器侧引起冻结而损坏换热设备，使水进入制冷系统，造成空调机组报废。
10. 水源热泵利用方式中，闭式系统一般成本较高。而开式系统，能否寻找到合适的水源是使用水源热泵的限制条件。对开式系统，水源要求必须满足一定的温度、水量和清洁度。
11.受到不同地区及国家能源政策、燃料价格的影响，水源的基本条件的不同；一次性投资及运行费用会随着用户的不同而有所不同。